三寶的類別，可分為四種：
（一）別相三寶
別相三寶是指佛在世時，曾經停留在人間，與眾生接觸過的三寶，有大小乘的分別。大乘三寶中的佛寶，是指最初成道的毘盧遮那佛；法寶是指華嚴經，與其他一切大乘經典；僧寶是當時在佛座下，協助佛陀教化眾生的大菩薩僧。若就從體起用，應小乘機言：則現丈六金身的釋迦牟尼佛是佛寶；佛所說的四諦、十二因緣等教、理、行、果是法寶；依法修行，證得解脫道的三乘聖眾是僧寶。以其個別出現人間，教化眾生，佛不是法，法不是僧，形相不同，彼此互異，所以名別相三寶，又名化相三寶。
（二）住持三寶
佛滅度後，流傳於世間的佛像，無論是紙晝，木刻，泥塑，銅鑄，都可以代表釋尊，令禮拜恭敬的人滅罪生福，是住持佛寶。佛弟子將釋尊一代時教，所說的十二分經，結集成三藏聖典，是住持法寶。出家修行，弘揚佛法，能自行化他的比丘、比丘尼，是住持僧寶。
（三）自性三寶
自性，是指眾生本具的真如自性。真如自性，圓明覺照，是佛寶覺義；真如自性，不變隨緣，能出生十法界諸法，作為一切諸法的軌則，是法寶正義；真如自性，隨緣不變，不生不滅，清淨無染，是僧寶凈義。佛法僧三寶，皆依真如自性而建立，故名自性三寶；因為真如自性，是一切法所依據的理體，所以又名理體三寶。
（四）一體三寶
意思是三寶之中，各各互具三寶。例如佛寶，其本身覺照明了，是佛寶覺義；佛親證諸法實相理，是法寶正義；佛的身心清淨，是僧寶淨義。在法寶言：諸法實相，靈明覺照，是佛寶覺義；原本執持萬物，是法寶正義；原本清淨無染，是僧寶淨義。在僧寶言：僧眾修行，能立觀智，是佛寶覺義；能遵循軌則修行，破邪顯正，是法寶正義；能和合共處，清淨無諍，是僧寶淨義。三者互具，不可分割，故名一體三寶，又名同體三寶。
因為別相、住持二種，各有形式，有相貌可見，屬於事相三寶；自性與一體二種，只可以神會，不可以觀見，是屬於理性三寶。事理各二，共有四種三寶。